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单细胞RNA测序数据在实际运用中可能会涉及到不同个体，不同条件和组织间的多样本比较。为鉴定异质数据集下的特征细胞亚型挖掘，来自哈佛医学院生物医学信息学系的研究人员发表题为“Jointanalysisofheterogeneoussingle-cellRNA-seqdatasetcollections”的研究，开发了一种称为Conos的方法。
二代转录组测序已经如火如荼的开展了近十几年，关于mRNA研究的文章也呈爆发式的发展，但是最近几年单纯的mRNA检测似乎不再那么吃香了。我们来看一组数据，下图是Pubmed数据库中检索mRNA得到的相关的文献信息，数据显示2015年时普通mRNA文献已经达到峰值，随后关于mRNA的文章开始有下滑的…
发表期刊：Nature.影响因子：43.07.发表时间：2019Aug21.摘要：阐明人类大脑皮层的细胞结构对于理解我们的认知能力和对疾病的易感性至关重要。.在这里，作者使用单核RNA测序分析对人类大脑皮层颞中回（middletemporalgyrus）的细胞类型进行了全面的研究...
常规的RNA测序分三大类：转录组测序（我们平时最多提到的RNA-seq）、小RNA测序、以及近两年比较火热的环状RNA测序。.这三大类测序的目标分子差别很大，因此一般也不会出现混淆。.其中转录组测序主要针对线性的mRNA以及lncRNA（长非…
只获得了单细胞测序数据就结束了吗？难道我看的不是全部文章内容？小编傻眼了，重复确认了好几次，确认这就是全文。难道只是提交单细胞测序实验数据就可以发表5分文章吗？带着这样的疑问，小编开始搜索了该期刊：SCIENTIFICDATA（SciData）。
转录组文章怎么写能发2区文章？.随着测序成本的下降，转录组测序已经逐步成为分子生物学实验的标配，每年有大量的数据产出，这也导致了转录组测序分析的文章越来越难以发表。.今天小编就给大家带来一篇今年10月份见刊的转录组文章，该文章发表在BMC...
盘点丨单细胞测序11月发表了哪些文献.其明技术专家基础科研2019年12月18日.2.24K00.以下文章依然按照影响因子高低进行排列：.1.IF:43.标题：GeneticpredispositiontomosaicYchromosomelossinblood.PMID：31748747发表期刊：Nature影响因子：43.07发表时间…
转录组入门（2）：读文章拿到测序数据本系列课程学习的文章是：AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.
在RNA-seq用于研究RNA相关的各方面生物学问题，包括单细胞基因表达、RNA翻译、RNA结构、空间转录学、全转录组、RNA-蛋白互作等。早前NatureReviewsGenetics发表了一篇综述，全面介绍了RNA-seq的发展。
相关成果近日在线发表在美国《公共科学图书馆—综合》（PLOSONE）杂志上。据介绍，近年来，小RNA的研究发展迅猛，各种类型的小RNA相继被发现和鉴定。在小RNA高通量测序数据中，经常会发现存在相当数量的、和核糖体DNA完全匹配的小RNA。但...
小RNA利用第二代高通量测序技术,对某物种某组织在特定状态下的18-30nt(或18-40nt)的小RNA进行高通量测序,通过数据库比对进行信息分析。SmallRNA测序是基于illuminaHiSeq2500测序平台,
小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程
项目描述是:C57BL/6Nmice,两种类型controldietor60%highfatdiet,然后是withorwithoutDENinjection的两个处理情况,做的是livertissueRNAsequencing,每个条件...
目前小RNA高通量测序数据的挖掘能力还十分有限,已发表文献中所挖掘出的小RNA也只是数据中很小的一部分,而用于数据挖掘的综合软件也不多见,多是针对某些特殊需求...
smallRNA测序产品介绍常见问题经典案例结果展示结果展示smallRNA筛选对各样品的cleanreads,筛选一定长度范围内的sRNA来进行后续分析。一般来说,sRNA的长度区间为18~40nt,长度分布的峰能帮...
研究表明,数据分析的算法会对RNA测序产生很大影响,不同算法生成的转录本数据存在很大差异。(更多详细信息参见:石乐明教授Nature子刊:RNA测序到底可不可靠)前几天,浙江大学和哈佛大...
这种叫做DM-tRNA-seq的技术适用于在所有生物体中开展tRNA研究。这一重要的研究成果发布在7月27日的《自然方法》(NatureMethods)杂志上。■RNA测序实用工具:三篇文章介绍RN...
SmallRNA(主要包括miRNA、piRNA、siRNA)调控靶基因表达,参与生长发育过程和疾病发生发展,小RNA测序可快速鉴定出已知和未知的小RNA,为研究小RNA的功能及调控机制提供有力工具。...
NCBI’sGeneExpressionOmnibus(GEO))。我当初发表小RNA文章时都是提交了数据链接的，如：MicroRNAs...
我存放下机数据的硬盘坏了(数据确定找不回来),有哪些期刊不需要上传原始数据的吗?我做的是转录组和lncRNA组方面的。。回复1收藏邀请讨论···SCI/EI期刊论...