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腊八醋w
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papapaopao

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American Journal of Preventive Medicine《美国预防医学杂志》美国ISSN:0749-3797,1984年创刊,全年8期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子3.167。刊载预防医学基础和应用研究论文。涉及的学科包括流行病学、遗传学、营养学、毒理学和社会科学;应用的领域包括卫生管理、传染病防治、职业医学、环境卫生、航空航天医学、老年病、母婴保健、计划生育等。Annales de Génétique《遗传学纪事》法国ISSN:0003-3995,1958年创刊,全年4期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子0.625。法国遗传学会的会刊。刊载遗传学研究论文、技术札记、文摘和消息。Biochimie《生物化学》法国ISSN:0300-9084,1914年创刊,全年12期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子2.461。刊载有关酶学、遗传学、免疫学、微生物学和高分子结构等方面的研究论文及评论。Biomolecular Engineering《生物分子工程》荷兰ISSN:1389-0344,1983年创刊,全年6期,Elsevier Science出版社,SCI、EI收录期刊,SCI 2005年影响因子1.435,2005年EI收录30篇。研究分子生物学、细胞生物学、免疫学、生物化学和遗传学中使用的新技术、材料及器械。刊载研究论文和综论。Cancer Genetics and Cytogenetics《癌遗传学与细胞遗传学》美国ISSN:0165-4608, 1979年创刊,全年16期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子1.640。刊载癌细胞与分子的基础研究论文。反映癌遗传学和细胞遗传学领域的最新研究进展。Current Opinion in Genetics & Development《遗传学与发育新见》英国ISSN: 0959-437X, 1991年创刊,全年6期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子9.361。著名遗传学权威专业性学术期刊,SCI收录期刊最高影响因子100种之一,刊载分子遗传学、疾病遗传学、遗传组织与变异、细胞繁殖、发育模式与机理等方面的研究进展评论。附近期有关学科主要论文索引。Developmental Biology《发育生物学》美国ISSN:0012-1606,1959年创刊,全年24期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子5.234。著名生物学权威专业性学术期刊,从分子、细胞和遗传的水平上研究动植物发育、变异、生长、再生和组织修复的机能。发表论文。European Journal of Medical Genetics《欧洲医学遗传学》ISSN: 1769-7212,2005年创刊,Elsevier Science出版社,主要刊载关于给类人研究和医学遗传学以及基因实验模型方面的论文。European Journal of Pharmacology: Molecular Pharmacology《欧洲药理学杂志:分子药理浙江工业大学图书馆信息咨询部编 Elsevier Science 出版社期刊投稿指南 60学分册》荷兰ISSN:0922-4106,1989年创刊,全年12期,Elsevier Science出版社,刊载分子水平的药理学、药效学、神经系统药理学等方面的研究论文和简报,内容涉及分子神经传递,信号转导机理,蛋白质受体的遗传反应等。Human Immunology《人类免疫学》美国ISSN:0198-8859,1980年创刊,全年12期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子2.467。刊载人类免疫系统和其他脊椎动物模拟系统的研究论文。侧重于组织适应性和免疫遗传学的研究。Infection, Genetics and Evolution《传染、遗传和进化》荷兰ISSN:1567-1348,2001年创刊,全年4期,Elsevier Science出版社。主要刊载遗传学领域,包括疾病等的传染、遗传、进化等方面的论文。Journal of Molecular Biology《分子生物学杂志》英国ISSN:0022-2836,1959年创刊,全年50期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子5.229。刊载原始论文,论述分子生物学的各个方面,涉及基因结构、复制及解译机理、蛋白质、核酸等大分子的结构和性质、细胞和发育生物学、分子遗传学等。Molecular Genetics and Metabolism《分子遗传学与新陈代谢》美国ISSN:1096-7192,1976年创刊,全年12期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子2.678。1998年前刊名为Biochemical and Molecular Medicine,从生物化学和分子生物学角度对人体正常代谢和代谢病进行研究。发表原始论文、短评和简讯。Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis《突变研究-突变原理与分子结构》荷兰ISSN:1388-2112,1964年创刊,Elsevier Science出版社。主要刊载关于包括遗传变异基因的作用,并体现突变,可变化合物的代谢方式到以不同的身份和修复受损DNA的细胞复制等方面的论文。Mutation Research/Genetic Toxicology《突变研究—遗传毒理学》ISSN: 0165-1218,Elsevier Science出版社,主要刊载化学物质的遗传毒性测试,以及对人类群体的遗传毒性效应、发育、进化的监督,监控等方面方面的文章。Mutation Research/Genetic Toxicology《突变研究—遗传毒理学》ISSN: 0165-1218,Elsevier Science出版社,主要刊载化学物质的遗传毒性测试,以及对人类群体的遗传毒性效应、发育、进化的监督,监控等方面方面的文章。Mutation Research/Reviews in Mutation Research《突变研究-突变研究评论》荷兰ISSN:1383-5742,1964年创刊,全年6期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子5.333。主要刊载突变和疾病的关系,涵盖人类基因组研究进展(包括演变和功能基因突变检测技术)与临床应用遗传学、基因治疗、环境健康风险评估,遗传毒理学和环境突变(包括遗传因素调节活性剂环境)等方面的论文。Trends in Genetics《遗传学趋势》英国ISSN:0168-9525,1985年创刊,全年12期,Elsevier Science出版社,SCI收录期刊,SCI 2005年影响因子12.047。权威专业性学术期刊,SCI收录期刊最高影响因子100种之一,刊载分子遗传学、变异、发育方面的评论、札记和书评,涉及临床遗传学、遗传学与社会、应用技术与人口遗传学等问题。

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沙发里的土豆

PBDEs被公认为新兴的一种普遍存在的 持久性有机污染物 ,通常在聚合物泡沫、建筑材料、塑料、电子和家具中用作阻燃剂。其中BDE-47由于分布广泛,并具有高亲脂性和半衰期长的特点,是在环境中检测到的最普遍的PBDEs之一。2,2‘,4,4’-四溴联苯醚(BDE-47)是一种主要的多溴二苯醚(PBDE)。累积的研究表明,BDE-47可以诱导代谢反应并改变动物和人类细胞中相关基因的表达。然而,关于BDE-47在作物中引起的代谢组学和转录组学改变的分子机制的研究较少。

2,2‘,4,4’-四溴联苯醚(BDE-47)是一种主要的多溴二苯醚(PBDE),因其对环境的影响而受到广泛关注。本研究分别对 两个水稻品种 , BDE-47耐受 的连粳7号(LJ-7)和 敏感 的品种甬优9号(YY-9)进行了代谢组学和转录组分析,研究它们对BDE-47耐受能力不同的分子机制。研究发现:

3.代谢途径和KEGG富集分析表明,BDE-47抑制了这两个水稻品种能量消耗和生物合成等许多生物学过程。而BDE-47增加了YY-9的能量消耗,而抑制了生物合成过程,导致YY-9对BDE-47的敏感性。

综合分析表明, 这两个水稻品种对BDE-47反应的不同防御能力归因于它们在能量消耗策略和籽粒营养成分生物合成方面的差异 。本研究为多溴二苯醚污染地区的水稻栽培提供了有益的参考。

本研究选择BDE-47的 耐受性材料LJ-7和敏感性材料YY-9 ,分别种植于 0、1、10和50 mg/kg BDE-47四个不同浓度 的土壤中,约180天后收集谷物。分析两个水稻品种BDE-47浓度及地上部分长度测定,同时去除稻壳后得到糙米进行转录组和代谢组分析。通过对 差异表达基因和差异代谢物的联合分析 ,挖掘不同抗性材料对不同浓度BDE-47的分子响应机制。

通过GC-MS对两个抗性差异品种籽粒中代谢产物的变化进行了分析,经BDE-47处理后, 两品种中代谢物含量相比对照组都发生明显变化,尤其是10 mg/kg和50 mg/kg浓度组与对照组相比差异显著。这两个品种的代谢产物含量表现出相反的趋势。 与对照组相比,LJ-7中的65种代谢产物和YY-9中的45种代谢产物的浓度变化显著。

经PCA分析,发现不同浓度污染物中代谢物分布的区别 :

RNA-Seq结果表明,两个水稻品种 表达的基因总数不同 。在LJ-7籽粒中检测到55802个基因,在YY-9中检测到55986个基因。

FDR<0.05的基因被定义为差异表达基因(DEG)。通过火山图可以直观的看到,

DEG 的 GO 和 KEGG 富集分析 为了深入了解DEG的生物学意义,研究人员进行了GO和KEGG富集分析。GO富集分析发现所有DEG可分为生物过程、细胞组成和分子功能三大类。

KEGG富集分析发现,

KEGG富集分析表明,两个品种的代谢途径均增强,表明DEG与代谢物关系密切。

整体来说,在YY-9的谷物中TCA循环增加,而糖和氨基酸的生物合成受到抑制。而LJ-7品种的谷物糖代谢、氨基酸代谢生物合成相关酶增加。

研究人员通过代谢途径分析暴露于BDE-47的两个水稻品种的生物学过程的变化。分析发现,LJ-7和YY-9分别有12条和4条代谢途径显著变化。两个品种的氨基酸代谢、糖代谢和三羧酸循环(TCA循环)均发生了显着变化。

为了在转录组水平上研究BDE-47对LJ-7和YY-9细胞的代谢反应机制,研究人员重点研究关键生物学过程相关基因的表达水平。结合代谢组学结果,重点研究了 糖代谢、氨基酸代谢和TCA循环途径的基因表达 。代谢物浓度的变化与相关酶的基因表达是一致的。

在LJ-7中,大部分编码上述三个途径中的关键酶的基因表达上调:

YY-9与LJ-7相比,大部分编码上述三个途径中的关键酶的基因表达下调:

YY-9籽粒中的TCA循环被激活,而糖和氨基酸的生物合成受到抑制。

糖代谢: LJ-7在暴露于10和50 mg / kg的BDE-47后, d-葡萄糖的含量增加了约1.3倍。d-葡萄糖作为光合作用的重要产物,是谷物的主要的碳和能源来源。其次己糖激酶的水平增加,由于只有磷酸化的己糖在植物的生命活动中有效,因此己糖激酶被认为在己糖磷酸化的信号传递中起关键作用。己糖激酶在糖利用的调节中起双重作用,其一可充当糖酵解过程中d-葡萄糖和d-果糖的传感器;其二可作为ROS自由基的清除剂,防止氧化损伤植物细胞。LJ-7谷物中的酶和代谢产物共同抵抗BDE-47暴露后的能量消耗。而在YY-9的谷粒中大部分基因受到抑制,与相关代谢产物的变化一致,这表明YY-9无法产生更多的能量物质来对抗BDE-47的暴露。

氨基酸代谢: 将LJ-7品种分别暴露于10 mg / kg和50 mg / kg的BDE-47后,籽粒中L-赖氨酸的含量分别增加了2.9倍和7.4倍。L-赖氨酸在应对非生物胁迫条件如水分限制、营养限制和氧化胁迫中起重要作用。转录组发现与l-赖氨酸相关的基因表达增强,进一步的促进赖氨酸的生物合成从而发挥抗性品质。与LJ-7中的氨基酸不同,YY-9的谷物中氨基酸变化不显著。综上所述,两个品种之间氨基酸代谢的显着对比表明,在暴露于BDE-47的条件下,LJ-7在植物生长中采取了更为复杂的反应。与YY-9相比,LJ-7中糖和氨基酸的代谢相对活跃,从而解释它们对BDE-47的耐受性的差异。

结论 利用水稻籽粒代谢组学和转录组相结合的分析方法,研究了两个水稻品种对BDE-47抗性的分子差异。

这些结果为揭示环境污染物对水稻不同生物效应的分子机制提供了有益的启示。

评论 代谢组学和转录组学的综合分析揭示了接触BDE-47引起的代谢物和基因的变化。本研究重点关注水稻籽粒中发生的代谢和转录变化。对作物如何系统地对不利环境做出反应提供了新的见解,旨在帮助育种计划中的生物标记物选择,并降低可能受到多溴二苯醚污染的农田中的作物健康风险。但是BDE-47对粮食产量和品质的影响目前仍不清楚。利用这两个水稻品种进一步研究环境污染物对作物品质的影响,探索较低浓度的BDE-47和其他污染物的潜在影响是后续研究的重点。

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